《道路交通安全法》第一百一十二条第二款规定，机关交通管理部门对被扣留的车辆应当妥善保管，不得使用。根据这一规定，机关扣留车辆后，应当将车辆停放在指定的地点，并妥善保管，任何人不得使用被扣留的车辆，包括机关等执法部门的人员也不能使用。如果因保管不善造成车辆损坏的，机关还应当修复或赔偿。机关交通管理部门扣留机动车、非机动车，是根据法律规定对交通违法行为人或者 交通事故 进行处理所采取的一种行政性强制措施，其目的是为了保证法律的执行和维护交通安全秩序，因此机关交通管理部门不能使用被扣留的车辆。